Sequence analysis: CLC main workbench and Bioedit

當我們的定序送回來的時候，可能不是一整條的gene，而是有好幾個片段，所以分析之前要先把這些片段連起來。因為之後blast的時候，檔案必需要符合特定的格式，因此可以使用 CLC main workbench來連接這些片段。

打開 CLC main workbench 進入 limit mode，然後先匯入要連接的sequence。

開始使用NCBI GENE

我大學的時候就知道NCBI了，但是我只會使用Pubmed。這次的作業是NCBI的gene。在關鍵字後面加入[ ]，就可以過濾一些資料，讓查資料的時候更有效率。

Find genes by...	search text
free text	liver fibrosis
partial name and multiple species	platelet[title] AND "homo sapiens"[orgn]
chromosome and symbol	(IV[chr] OR 4[chr]) AND pf* [sym]
associated sequence accession number	M25897[accn]
gene name (symbol)	pf4[sym]
publication (PubMed ID)	1695112[pmid]