MeV 是一個分析 microarray 的一個軟體。
1. 首先打開MeV,新增一個 New multiple array viewer
2. File > Load data > select file loader > 選擇匯入檔案的格式 > browse > load
3. Adjust data > normalization > total intensity
before & after
Clustering > Hierarchical clustering (HCL)
1D: gene 間的 clustering
2D: gene 之間和 sample 之間的 clustering
Virtualization > General distance matrix (GDM)
了解gene之間的相關性
圖示說明了顏色越紅,相關性越高
Clustering > k-means/medians clustering
手動將 gene or samples 分類比較
Clustering > cluster affinity search technique
電腦自動把gene分類比較
把結果 normalization by rows 之後,再做一次CAST,比較能看出彼此間的差異
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